13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0494 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  100 
 
 
735 aa  1438    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  35.53 
 
 
882 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  31.82 
 
 
368 aa  101  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  29.25 
 
 
1015 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 
943 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  26.08 
 
 
1162 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  28.09 
 
 
750 aa  77.4  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  32.86 
 
 
544 aa  65.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  25.75 
 
 
359 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  27.32 
 
 
664 aa  60.1  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0979095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  23.72 
 
 
942 aa  57.4  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1780  hypothetical protein  31.03 
 
 
363 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  26.88 
 
 
647 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>