28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1391 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1391  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1054    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.706287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1349  hypothetical protein  88.05 
 
 		 544 aa  848    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  34.77 
 
 		 882 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  33.96 
 
 		 368 aa  105  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1350  hypothetical protein  43.14 
 
 		 158 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00610179  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1392  hypothetical protein  43.79 
 
 		 158 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1015 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23150  hypothetical protein  35.51 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0713276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 943 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1250  hypothetical protein  33.1 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0112345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1555  hypothetical protein  36.09 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0172982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  28.12 
 
 		 1162 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  30.28 
 
 		 735 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23110  hypothetical protein  31.03 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1554  hypothetical protein  34.85 
 
 		 173 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0177061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0381  tetratricopeptide TPR_4  27.12 
 
 		 359 aa  67  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1046  hypothetical protein  29.77 
 
 		 180 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1249  hypothetical protein  31.82 
 
 		 169 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00744542  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2440  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.356903  normal  0.805488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4638  hypothetical protein  30.15 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55835  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23160  hypothetical protein  28.79 
 
 		 194 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0690851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10560  hypothetical protein  25.74 
 
 		 153 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2988  hypothetical protein  32.77 
 
 		 165 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4022  hypothetical protein  28.98 
 
 		 750 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000110855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3914  hypothetical protein  27.13 
 
 		 194 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3539  hypothetical protein  26.72 
 
 		 194 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  24.09 
 
 		 942 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  26.84 
 
 		 664 aa  43.9  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0979095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>