11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0963 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0963  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  683    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0694  Tetratricopeptide TPR_4  31.01 
 
 
1162 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4207  Tetratricopeptide TPR_4  24.14 
 
 
882 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.024812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1780  hypothetical protein  41.11 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1830  hypothetical protein  30.66 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0268  hypothetical protein  26.09 
 
 
1015 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.564116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23130  hypothetical protein  25 
 
 
664 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0979095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2986  hypothetical protein  27.15 
 
 
647 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2462  hypothetical protein  20.1 
 
 
942 aa  46.2  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0374837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 
943 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0494  hypothetical protein  39.68 
 
 
735 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>