177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4580 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  100 
 
 
319 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.33 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  42 
 
 
302 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  41.96 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.54 
 
 
302 aa  206  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  40.34 
 
 
312 aa  206  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1391  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.78 
 
 
306 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03343  putative D-cysteine desulfhydrase  37.2 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00640  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  40 
 
 
289 aa  199  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1372  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.63 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0431  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.95 
 
 
311 aa  195  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.17 
 
 
310 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0953  putative D-cysteine desulfhydrase, DcyD  39.93 
 
 
314 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1895  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  37.41 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0834874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.14 
 
 
287 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1914  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.35 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1541  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  31.68 
 
 
297 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.974247  normal  0.412213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3802  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  32.03 
 
 
314 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2009  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  31.35 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3733  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  31.68 
 
 
297 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6027  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.19 
 
 
259 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.581609  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1730  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  33 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1676  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  30.07 
 
 
314 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334967  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1569  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  31.25 
 
 
299 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.836174  normal  0.209686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.05 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24190  putative 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  28.76 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0268894  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2947  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  29.67 
 
 
314 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.271855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2048  ACC deaminase/D-cysteine desulfhydrase family protein  29.1 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0600526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3686  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  29.19 
 
 
312 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  30.1 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  30.1 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  28.06 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  30.5 
 
 
340 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2162  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  28.47 
 
 
312 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0392224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  25.55 
 
 
332 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5532  D-cysteine desulfhydrase  26.92 
 
 
343 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.1518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2397  D-cysteine desulfhydrase  31.86 
 
 
337 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0310  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  27.81 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  25.15 
 
 
332 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  27.65 
 
 
330 aa  95.9  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  27.27 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6848  D-cysteine desulfhydrase  26.92 
 
 
342 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  23.44 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  25.88 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2428  D-cysteine desulfhydrase  31.06 
 
 
340 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  27.55 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  25.88 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  26.21 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  25.24 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  25.55 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  26.05 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  26.18 
 
 
331 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  25.55 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  26.5 
 
 
331 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  26.73 
 
 
365 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  25.24 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  25.24 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  26.96 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1432  D-cysteine desulfhydrase  31.08 
 
 
340 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.189366  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5685  D-cysteine desulfhydrase  27.12 
 
 
337 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104334 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  26.05 
 
 
340 aa  89.4  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  27.15 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  27.72 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  24.83 
 
 
328 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
342 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  25.48 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  25.34 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  25.8 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  26.01 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  25.8 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  25.8 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  24.92 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  23.96 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  24.92 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  24.92 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  25.17 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  24.92 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  24.92 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  24.92 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  24.92 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  25.93 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5055  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.62 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0798685  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0767  D-cysteine desulfhydrase  29.12 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0197666  hitchhiker  0.00499995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  24.84 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1439  D-cysteine desulfhydrase  25.61 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457826  normal  0.632152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0934  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.96 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6869  D-cysteine desulfhydrase  25 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4875  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.3 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338198  normal  0.0605398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  26.06 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  26.06 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  26.06 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  24.76 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  26.06 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  25.24 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  25.73 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>