72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3549 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3549  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  551  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1753  hypothetical protein  31.64 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1550  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1366  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0144221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1968  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1904  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  0.448983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1910  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1610  hypothetical protein  26.24 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119985  normal  0.579551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01253  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2334  putative transcriptional regulator  29.12 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1993  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236117  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2559  hypothetical protein  26.54 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.026679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004200  protein SirB1  27.87 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1928  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0634354  normal  0.0610741 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2412  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.402469  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1378  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0629002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1362  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00721974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01189  predicted transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.506875  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1695  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0244126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1858  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01199  hypothetical protein  29.79 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1319  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000562395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2433  sirB1 protein  29.79 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00804318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2176  putative transcriptional regulator  27.83 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.064164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2457  putative transcriptional regulator  27.83 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2063  putative transcriptional regulator  27.83 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000599802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2111  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2404  putative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0947  hypothetical protein  33.13 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0793  protein SirB1  29.65 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2075  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0807  hypothetical protein  32.06 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0773  hypothetical protein  31.54 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3165  hypothetical protein  31.54 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0801  hypothetical protein  31.54 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3829  hypothetical protein  30.77 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3610  hypothetical protein  28.21 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0588613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2563  hypothetical protein  26.98 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.610667  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3542  hypothetical protein  28.21 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000309634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3733  hypothetical protein  28.21 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2906  hypothetical protein  33.08 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.849831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0701  hypothetical protein  28.21 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0726  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.935088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0923  hypothetical protein  34.94 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00500148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3676  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0503  hypothetical protein  24.35 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794885  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2767  hypothetical protein  27.47 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1758  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.542914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3452  hypothetical protein  27.27 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2428  hypothetical protein  24.22 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2834  hypothetical protein  25.11 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0834  hypothetical protein  26.81 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0745  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3123  hypothetical protein  28.23 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.292454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2894  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2906  hypothetical protein  25.68 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2558  hypothetical protein  23.32 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3285  hypothetical protein  27.73 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1368  hypothetical protein  26.47 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.880811 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2514  hypothetical protein  25.12 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0128  hypothetical protein  25.12 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0679  transcriptional regulator  25.12 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3024  hypothetical protein  24.55 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2475  hypothetical protein  24.26 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2624  hypothetical protein  24.1 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1078  hypothetical protein  24.76 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0925  hypothetical protein  24.76 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0922  hypothetical protein  24.76 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.425881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0737  hypothetical protein  23.81 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3633  hypothetical protein  24.26 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0761  hypothetical protein  20.87 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3201  hypothetical protein  20.87 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0130133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>