30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3313 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  100 
 
 		 411 aa  836    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  62.53 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  59.85 
 
 		 406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  56.2 
 
 		 410 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  55.12 
 
 		 382 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  41.65 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  39.47 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  37.83 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  37.23 
 
 		 408 aa  229  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  38.5 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  37.11 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  38.6 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  37.8 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  37.2 
 
 		 395 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  37.37 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  37.43 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  33.17 
 
 		 401 aa  196  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  36.2 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  30.64 
 
 		 482 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  31.75 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  27.97 
 
 		 472 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  31.16 
 
 		 451 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  30.21 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  28.83 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  25 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  26.16 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  24.13 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  26.7 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  28.98 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  25.97 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>