196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1574 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  100 
 
 		 189 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  57.07 
 
 		 195 aa  234  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  60 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  55.85 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  55.85 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  55.85 
 
 		 187 aa  215  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  54.79 
 
 		 187 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  52.69 
 
 		 192 aa  214  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  55.32 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  54.26 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  54.26 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  54.26 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  52.69 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  54.26 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  57.92 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  52.72 
 
 		 188 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  50 
 
 		 188 aa  198  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  51.31 
 
 		 192 aa  194  6e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  52.11 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  51.06 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.15 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  47.62 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  47.64 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  46.03 
 
 		 191 aa  184  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  44.85 
 
 		 192 aa  160  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  39.89 
 
 		 191 aa  154  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  41.62 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  58.82 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  56.52 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  55.88 
 
 		 72 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  59.42 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  53.62 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  59.42 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  45.16 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  54.55 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  56.52 
 
 		 73 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  52.86 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.66 
 
 		 111 aa  72  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  56.06 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.71 
 
 		 111 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  52.24 
 
 		 72 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  46.81 
 
 		 99 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  66.67 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  55.38 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  54.55 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  54.55 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.86 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  41.84 
 
 		 101 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  52.31 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  56.52 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  42.68 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.48 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.12 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.42 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.75 
 
 		 113 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  43.9 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  46.97 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.65 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3747  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.56 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  52.17 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.05 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.78 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.78 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  50.75 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.1 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  45.12 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.32 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  50.75 
 
 		 69 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  42.17 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.24 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.32 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.32 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  49.25 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  49.25 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.32 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.97 
 
 		 114 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  50.75 
 
 		 69 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  48.57 
 
 		 70 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.32 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  52.31 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.32 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  38.32 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  38.32 
 
 		 120 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.48 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  37.74 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  50 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.68 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  46.27 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  48.48 
 
 		 69 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3770  hypothetical protein  48 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.24 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.68 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.11 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2533  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.9 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.98 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>