More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1319 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  77.39 
 
 		 118 aa  189  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  66.38 
 
 		 119 aa  167  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  63.79 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  44 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  39.82 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  42.27 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  42.55 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  41.51 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  40.59 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  34.21 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  42.27 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  41 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  40.22 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  38.3 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  42.22 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  43.33 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  35.85 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  36.04 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  36.04 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  36.04 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  40.78 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  38.3 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  38.3 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  41 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.43 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  37.23 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2078  transcriptional regulator, HxlR family  40.68 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  42.22 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  40.86 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  42.22 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  36.36 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  42.22 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  42.22 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  42.22 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  42.22 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  40 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  40 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  42.22 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  42.22 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  36.46 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3102  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  41.11 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  36.46 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  40 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  40 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  36.17 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  41.11 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  40 
 
 		 220 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  41.76 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  41.76 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  41.76 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>