52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0097 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0097  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2687  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3083  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.23 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  24.1 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.488823  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0244  hypothetical protein  32.99 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  32.99 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.7 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.56 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.46 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.46 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  24.1 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.69 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.68 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1428  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.96 
 
 		 127 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4606  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.18 
 
 		 124 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4020  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.93 
 
 		 123 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3725  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.93 
 
 		 123 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  22.46 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3903  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.57 
 
 		 120 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.845476  normal  0.334564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2785  hypothetical protein  29.11 
 
 		 114 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1516  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.5 
 
 		 123 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0637  hypothetical protein  22.22 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.046264  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5197  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.32 
 
 		 114 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1826  hypothetical protein  34.44 
 
 		 119 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.756996  normal  0.856699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3108  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.55 
 
 		 119 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  29.47 
 
 		 121 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30 
 
 		 116 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3501  hypothetical protein  28.41 
 
 		 124 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.41 
 
 		 121 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.41 
 
 		 121 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1082  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.41 
 
 		 121 aa  45.8  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000597126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.87 
 
 		 117 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4843  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.08 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.77141  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  26.21 
 
 		 126 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  26.6 
 
 		 119 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.6 
 
 		 119 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1908  hypothetical protein  30.68 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.346716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  25.23 
 
 		 122 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  27.59 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  25.53 
 
 		 121 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3205  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.3 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1090  hypothetical protein  28.41 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00838125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  25.53 
 
 		 119 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1184  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.41 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.831048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1150  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.41 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00929773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.53 
 
 		 119 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.72 
 
 		 130 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  25.88 
 
 		 126 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  23.85 
 
 		 128 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  23.71 
 
 		 121 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  26.32 
 
 		 120 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>