More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1385 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1385  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
399 aa  818    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.888819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1200  dihydroorotase, multifunctional complex type  98.75 
 
 
399 aa  808    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0128604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0660  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.94 
 
 
398 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0782  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.45 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.32 
 
 
425 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.32 
 
 
428 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.06 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  36.26 
 
 
426 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.94 
 
 
425 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.61 
 
 
429 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.71 
 
 
424 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.71 
 
 
425 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.77 
 
 
432 aa  271  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.45 
 
 
437 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.12 
 
 
424 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  36 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  36.56 
 
 
431 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.71 
 
 
441 aa  270  5e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 
430 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  37.7 
 
 
425 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  33.02 
 
 
427 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  35.85 
 
 
425 aa  258  9e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.64 
 
 
434 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.81 
 
 
429 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
427 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.8 
 
 
434 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.89 
 
 
436 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.3 
 
 
431 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  36.64 
 
 
425 aa  258  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  36.17 
 
 
431 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  36.08 
 
 
425 aa  256  5e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.11 
 
 
431 aa  256  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  32.86 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  35.29 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  32.63 
 
 
431 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  32.63 
 
 
431 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  32.63 
 
 
431 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  35.29 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  35.29 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  35.29 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  35.29 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  35.29 
 
 
428 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  35.29 
 
 
428 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  34.9 
 
 
427 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  35.06 
 
 
428 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  36.41 
 
 
423 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  34.76 
 
 
425 aa  250  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0816  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.49 
 
 
424 aa  249  7e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  34.53 
 
 
425 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  32.31 
 
 
442 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
428 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.92 
 
 
425 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  36.17 
 
 
426 aa  248  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  34.21 
 
 
425 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  33.41 
 
 
425 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  34.59 
 
 
428 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  34.82 
 
 
428 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.79 
 
 
430 aa  246  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  34.82 
 
 
428 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  32.55 
 
 
431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  35.2 
 
 
425 aa  245  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  35.2 
 
 
425 aa  245  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  34.81 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.99 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  33.88 
 
 
431 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  34.35 
 
 
429 aa  242  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.72 
 
 
435 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.48 
 
 
429 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.58 
 
 
426 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  34.81 
 
 
436 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  32.31 
 
 
433 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  34.44 
 
 
426 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  33.09 
 
 
431 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  34.57 
 
 
428 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.8 
 
 
430 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  34.12 
 
 
430 aa  236  4e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  33.72 
 
 
423 aa  236  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  32.16 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.76 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  33.74 
 
 
431 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  31.82 
 
 
432 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  32.55 
 
 
435 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.47 
 
 
436 aa  233  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.81 
 
 
442 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  32.46 
 
 
430 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  31.42 
 
 
459 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.43 
 
 
433 aa  230  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.24 
 
 
433 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  33.17 
 
 
433 aa  229  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  32.24 
 
 
432 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  31.36 
 
 
449 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12670  dihydroorotase  30.61 
 
 
446 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0696106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  33.42 
 
 
428 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3201  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.47 
 
 
447 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  32.38 
 
 
451 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  33.18 
 
 
428 aa  222  9e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  32.15 
 
 
428 aa  222  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0755  dihydroorotase multifunctional complex type  31.87 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  32.64 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.33 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>