More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00440 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  52.37 
 
 
809 aa  815    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  100 
 
 
802 aa  1623    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  54.59 
 
 
795 aa  844    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.91 
 
 
363 aa  415  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5547  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
355 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228319  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.12 
 
 
359 aa  412  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.12 
 
 
359 aa  412  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2167  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.34 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2955  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.35 
 
 
357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.53 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.06 
 
 
355 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0839286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1095  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.1 
 
 
357 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154044  hitchhiker  0.00642232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0963  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  60.96 
 
 
353 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.48 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240095  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.28 
 
 
422 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2118  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.35 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1966  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.8 
 
 
368 aa  402  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3852  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.61 
 
 
357 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1241  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.52 
 
 
357 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.853192  hitchhiker  0.000530935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1597  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
357 aa  395  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.438743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3331  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.14 
 
 
363 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3461  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.91 
 
 
357 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2326  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.65 
 
 
357 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.290709  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  57.85 
 
 
346 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1575  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  62.54 
 
 
357 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.48 
 
 
435 aa  392  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.56 
 
 
346 aa  389  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
355 aa  389  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.46 
 
 
425 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2063  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.1 
 
 
355 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2024  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.8 
 
 
355 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.82 
 
 
355 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226981  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0792  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.58 
 
 
356 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64269 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0765  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.94 
 
 
361 aa  385  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.05 
 
 
346 aa  385  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 
345 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  46.17 
 
 
1237 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.6 
 
 
359 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.73 
 
 
345 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  46 
 
 
429 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46 
 
 
429 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.6 
 
 
429 aa  382  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.05 
 
 
437 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1969  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.62 
 
 
348 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.26 
 
 
430 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.81 
 
 
346 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.73 
 
 
345 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0677  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.91 
 
 
348 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.5 
 
 
425 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.91 
 
 
429 aa  382  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 
345 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.43 
 
 
345 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2323  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.69 
 
 
357 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0553  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.38 
 
 
352 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.85 
 
 
423 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.6 
 
 
428 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.86 
 
 
346 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1889  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.11 
 
 
353 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0381482  normal  0.145753 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.3 
 
 
345 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.02 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.07 
 
 
356 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.39 
 
 
345 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  58.13 
 
 
346 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.07 
 
 
348 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.186748  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.33 
 
 
347 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.37 
 
 
416 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.31 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.31 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.6 
 
 
428 aa  379  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.35 
 
 
430 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.31 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.36 
 
 
350 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.82 
 
 
345 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.8 
 
 
431 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  57.31 
 
 
352 aa  376  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  56.76 
 
 
352 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.56 
 
 
345 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
345 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.19 
 
 
352 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.08 
 
 
427 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.13 
 
 
427 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.85 
 
 
347 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.36 
 
 
350 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.85 
 
 
351 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  47.37 
 
 
430 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.39 
 
 
430 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.81 
 
 
369 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.33 
 
 
347 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.26 
 
 
432 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.33 
 
 
347 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.43 
 
 
345 aa  376  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.52 
 
 
433 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.37 
 
 
416 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.72 
 
 
345 aa  376  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.48 
 
 
359 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  55.92 
 
 
348 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.76 
 
 
345 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>