50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI02730 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI02730  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  681    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.42672  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  27.43 
 
 		 558 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  29.12 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  28.22 
 
 		 593 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.73 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.41 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  29.43 
 
 		 778 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  32.22 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  25.61 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  25.4 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.23 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  27.71 
 
 		 577 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.25 
 
 		 556 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.06 
 
 		 1848 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.41 
 
 		 555 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 		 624 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.57 
 
 		 821 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.83 
 
 		 567 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.29 
 
 		 570 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  26.21 
 
 		 579 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.04 
 
 		 1679 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.3 
 
 		 561 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.68 
 
 		 818 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  36.22 
 
 		 1222 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  27 
 
 		 566 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  31.21 
 
 		 547 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.48 
 
 		 563 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  27.08 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  27.36 
 
 		 546 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  25.09 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  27.74 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.33 
 
 		 535 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  34.78 
 
 		 726 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  32.67 
 
 		 792 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43296  predicted protein  25.11 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  23.66 
 
 		 787 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  28.57 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.8 
 
 		 469 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.43 
 
 		 643 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.26 
 
 		 692 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  22.61 
 
 		 717 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  35.71 
 
 		 921 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  38.55 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  32.67 
 
 		 784 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  32 
 
 		 776 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  36.13 
 
 		 743 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  25.48 
 
 		 390 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  28.16 
 
 		 911 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  27.87 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  27.87 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>