45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04690 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE04690  vacuole protein, putative  100 
 
 
302 aa  617  1e-176  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  44.04 
 
 
516 aa  199  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45794  predicted protein  39.36 
 
 
286 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  30.88 
 
 
218 aa  109  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  40.21 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  44.12 
 
 
210 aa  84  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  44.86 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  42.86 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  42.7 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  38 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  36.36 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  38.71 
 
 
208 aa  56.6  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  31.4 
 
 
195 aa  55.8  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7690  predicted protein  34.09 
 
 
205 aa  55.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.113136  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  32.53 
 
 
196 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  39.53 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  28.24 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  36.9 
 
 
213 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  35.71 
 
 
216 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  34.18 
 
 
215 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  32.99 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 
218 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  26.56 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  39.08 
 
 
205 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  32.32 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  33.68 
 
 
191 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  34.52 
 
 
216 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  32.38 
 
 
108 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  39.51 
 
 
185 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  29.63 
 
 
212 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  29.87 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  31.17 
 
 
201 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  33.75 
 
 
190 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  34.74 
 
 
197 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  38.27 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  31.11 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  34.21 
 
 
188 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  29.21 
 
 
194 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  38.64 
 
 
195 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  32.35 
 
 
121 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  31.25 
 
 
122 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  30.56 
 
 
105 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>