27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03770 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB03770  expressed protein  100 
 
 
433 aa  909    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  29.57 
 
 
637 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  40 
 
 
632 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  22.09 
 
 
534 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  35.59 
 
 
559 aa  53.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  38.89 
 
 
537 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58891  predicted protein  38.1 
 
 
596 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650086  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  42.86 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  42.22 
 
 
531 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  36.54 
 
 
616 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  33.78 
 
 
724 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  31.03 
 
 
407 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49448  predicted protein  39.62 
 
 
270 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0291569  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  38.64 
 
 
439 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  28.57 
 
 
127 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28766  predicted protein  38.46 
 
 
143 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0634822  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  44.44 
 
 
551 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49494  predicted protein  36.96 
 
 
235 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  38.64 
 
 
831 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08310  ligase, putative  44.12 
 
 
883 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10251  RING and UBP finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10360)  42.86 
 
 
503 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  34.04 
 
 
238 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  30.12 
 
 
1761 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  41.86 
 
 
1025 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  33.33 
 
 
1348 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  38.3 
 
 
403 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01075  RING finger ubiquitin ligase (Tul1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12080)  51.85 
 
 
807 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0263562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>