More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0677 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  607  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  36.59 
 
 
293 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  35.66 
 
 
282 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  34.62 
 
 
288 aa  185  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  35 
 
 
288 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  35 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  35 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  35 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  35 
 
 
286 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  35.38 
 
 
295 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  35 
 
 
286 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  34.27 
 
 
282 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  36.68 
 
 
289 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  36.68 
 
 
289 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  36.68 
 
 
289 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  35.38 
 
 
295 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  35.16 
 
 
290 aa  175  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  34.87 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  36.61 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  34.11 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  33.72 
 
 
287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  33.72 
 
 
288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  35.29 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  35.02 
 
 
305 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  34.77 
 
 
288 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  33.98 
 
 
293 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  34.1 
 
 
287 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  32.83 
 
 
291 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  34.24 
 
 
288 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  32.7 
 
 
290 aa  169  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  32.95 
 
 
288 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  31.91 
 
 
293 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  33.1 
 
 
290 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  33.45 
 
 
290 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  33.2 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  33.59 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  33.68 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  34.07 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  33.08 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  33.2 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  33.68 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  33.2 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  33.68 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  33.45 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  32.19 
 
 
337 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  32.42 
 
 
288 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  32.81 
 
 
288 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  31.86 
 
 
292 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  32.68 
 
 
288 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  32.81 
 
 
288 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  32.81 
 
 
288 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  32.25 
 
 
286 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  32.07 
 
 
290 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  32.17 
 
 
286 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  31.91 
 
 
288 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  31.91 
 
 
288 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  31.91 
 
 
288 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  31.91 
 
 
288 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  31.78 
 
 
286 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  32.81 
 
 
303 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  31.51 
 
 
290 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  31.51 
 
 
290 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  31.51 
 
 
290 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  31.51 
 
 
290 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  31.51 
 
 
290 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  31.51 
 
 
290 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  32.95 
 
 
287 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  30.66 
 
 
320 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  31.52 
 
 
286 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  32.48 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  30.88 
 
 
337 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  31.54 
 
 
292 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  30.11 
 
 
328 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  30.53 
 
 
324 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  35.34 
 
 
285 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  28.73 
 
 
322 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  30.22 
 
 
290 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  29.77 
 
 
324 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  32.75 
 
 
286 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  30.58 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  30.93 
 
 
283 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  28.95 
 
 
328 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  28.95 
 
 
328 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  28.95 
 
 
328 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  30.53 
 
 
323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  29.9 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  29.45 
 
 
342 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  33.33 
 
 
298 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  30.97 
 
 
318 aa  135  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  30.43 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  29.62 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  33.46 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  30.31 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  30.48 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  31.02 
 
 
298 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  29.21 
 
 
307 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  28.1 
 
 
315 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>