More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1370 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  70.43 
 
 		 416 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  70.43 
 
 		 416 aa  637    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 416 aa  859    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  71.39 
 
 		 416 aa  647    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1784  adenylosuccinate synthetase  72.29 
 
 		 416 aa  636    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0153593  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2131  adenylosuccinate synthetase  72.53 
 
 		 416 aa  651    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  70.43 
 
 		 416 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  74.22 
 
 		 416 aa  674    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0075  adenylosuccinate synthetase  66.02 
 
 		 419 aa  590  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  60.14 
 
 		 415 aa  542  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  51.18 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  51.17 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  48.33 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  48.58 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  47.89 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  48.94 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  48.71 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  48.38 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  48.21 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 		 428 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  47.98 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3914  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.923104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  47.49 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  47.73 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  47.74 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  47.31 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  47.02 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  47.74 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  47.41 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  45.99 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002264  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 438 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.151372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  48.02 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  47.31 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  47.51 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  47.74 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  47.74 
 
 		 807 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  46.5 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  47.31 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  46.78 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  45.65 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  48.02 
 
 		 432 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  46.56 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  48.11 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  47.04 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  48.46 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 		 428 aa  395  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  47.76 
 
 		 427 aa  391  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  46.35 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  46.3 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  48 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  46.93 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  49.07 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  45.79 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  47.48 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  47.42 
 
 		 431 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  46.62 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  46.68 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  47.88 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3234  adenylosuccinate synthase  47.56 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000199193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  48.02 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  47.78 
 
 		 533 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  47.14 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  45.15 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  46.17 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  45.75 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  46.85 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  48.02 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  48.02 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  46.3 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2772  adenylosuccinate synthetase  47.22 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  47.03 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>