More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1283 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1283  uridylate kinase  100 
 
 
237 aa  473  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.476077  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0481  uridylate kinase  81.09 
 
 
245 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0502  uridylate kinase  77.73 
 
 
238 aa  373  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1214  uridylate kinase  80.59 
 
 
238 aa  349  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1410  uridylate kinase  75.95 
 
 
239 aa  345  3e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1290  uridylate kinase  75.95 
 
 
239 aa  345  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00947751  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0451  uridylate kinase  75.95 
 
 
239 aa  345  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.16518  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0615  uridylate kinase  76.27 
 
 
241 aa  343  1e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0645  uridylate kinase  77.22 
 
 
239 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0717  uridylate kinase  72.22 
 
 
237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  58.22 
 
 
236 aa  265  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  59.56 
 
 
239 aa  263  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  58.26 
 
 
238 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  60.19 
 
 
238 aa  262  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  54.89 
 
 
235 aa  258  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  57.33 
 
 
236 aa  258  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  57.33 
 
 
239 aa  258  8e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  57.85 
 
 
251 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  58.3 
 
 
235 aa  257  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.85 
 
 
251 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  56.44 
 
 
239 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  56.05 
 
 
245 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  57.85 
 
 
251 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  59.26 
 
 
238 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  56.44 
 
 
244 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  57.01 
 
 
245 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  56.95 
 
 
235 aa  254  8e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  57.47 
 
 
242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  56.05 
 
 
239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  54.74 
 
 
250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  58.37 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  55.56 
 
 
241 aa  252  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  57.33 
 
 
235 aa  251  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  56.56 
 
 
241 aa  251  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  54.55 
 
 
234 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  55 
 
 
244 aa  251  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  54.67 
 
 
240 aa  251  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  54.71 
 
 
239 aa  251  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  54.46 
 
 
239 aa  251  8.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  54.67 
 
 
240 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  56.56 
 
 
240 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  54.09 
 
 
234 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  56.56 
 
 
237 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  57.01 
 
 
239 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  55.66 
 
 
239 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  56.5 
 
 
237 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  55.2 
 
 
241 aa  248  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  53.78 
 
 
234 aa  248  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  52.38 
 
 
246 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  56.05 
 
 
237 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  52.38 
 
 
246 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  55.16 
 
 
235 aa  248  8e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  52.38 
 
 
246 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  56.36 
 
 
239 aa  248  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  54.05 
 
 
246 aa  247  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  52.77 
 
 
246 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  53.33 
 
 
237 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  55 
 
 
243 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  54.09 
 
 
241 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  55.2 
 
 
245 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  54.09 
 
 
241 aa  246  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  54.79 
 
 
237 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  55.76 
 
 
244 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  54.79 
 
 
237 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  54.3 
 
 
238 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  56.11 
 
 
236 aa  246  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  55.66 
 
 
242 aa  245  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  53.62 
 
 
249 aa  244  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  57.14 
 
 
240 aa  244  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  54.71 
 
 
243 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  56.34 
 
 
237 aa  244  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  53.64 
 
 
242 aa  243  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  53.85 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  55.25 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  53.3 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  54.09 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  54.09 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  52.97 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  54.95 
 
 
274 aa  242  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  53.18 
 
 
234 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  53.18 
 
 
242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  54.34 
 
 
237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  55.11 
 
 
239 aa  242  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  54.75 
 
 
241 aa  241  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  55.66 
 
 
247 aa  241  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  53.64 
 
 
243 aa  240  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  53.85 
 
 
241 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  53.85 
 
 
241 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  54.26 
 
 
239 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  54.3 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  54.19 
 
 
237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  49.79 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  53.39 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  52.97 
 
 
237 aa  238  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  52.68 
 
 
238 aa  238  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  55.5 
 
 
247 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2979  uridylate kinase  54.3 
 
 
243 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  54.3 
 
 
249 aa  237  9e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  52.02 
 
 
242 aa  238  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  52.49 
 
 
244 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>