33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1841 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  750    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  60.41 
 
 
396 aa  424  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  48.46 
 
 
393 aa  344  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  35.71 
 
 
423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  30.69 
 
 
411 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  32.41 
 
 
407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  32.29 
 
 
410 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  28.92 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  27.89 
 
 
434 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  26.62 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  26.48 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  28.46 
 
 
428 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  27.19 
 
 
428 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  28.46 
 
 
455 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  25.51 
 
 
466 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  24.26 
 
 
408 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  24.38 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  24.49 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  24.49 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  24.49 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  24.49 
 
 
438 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  24.69 
 
 
438 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  25.82 
 
 
452 aa  56.6  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  24.69 
 
 
456 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  26.17 
 
 
451 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  25 
 
 
499 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  24.01 
 
 
460 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4283  hypothetical protein  27.45 
 
 
451 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  25.52 
 
 
451 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  27.53 
 
 
426 aa  46.6  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  24.87 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  26.61 
 
 
432 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  22.49 
 
 
463 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>