160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0697 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0697  carbon storage regulator  100 
 
 		 76 aa  140  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0062  carbon storage regulator  80.26 
 
 		 76 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1669  carbon storage regulator, CsrA  55.17 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1631  carbon storage regulator  50 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.635349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0669  carbon storage regulator, CsrA  47.22 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0307434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2232  carbon storage regulator  46.88 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000917827 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1058  carbon storage regulator  50 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0714  carbon storage regulator  50 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0439  carbon storage regulator, CsrA  50.7 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2417  carbon storage regulator, CsrA  45.95 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0019  carbon storage regulator, CsrA  42.47 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0099  carbon storage regulator, CsrA  41.43 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0614  carbon storage regulator, CsrA  45.31 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1147  global regulator protein CsrA  42.11 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0673  carbon storage regulator, CsrA  45.16 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0697  carbon storage regulator, CsrA  45.16 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000794724  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1478  carbon storage regulator, CsrA  40.54 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2420  carbon storage regulator, CsrA  44.78 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0992  carbon storage regulator  43.94 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000161482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0885  carbon storage regulator  43.94 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.4873100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2005  carbon storage regulator, CsrA  40.91 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0196  carbon storage regulator  40 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2278  carbon storage regulator  56 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3026  carbon storage regulator  43.24 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0309  carbon storage regulator, CsrA  48.28 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4097  carbon storage regulator, CsrA  44.07 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0246  carbon storage regulator, CsrA  43.06 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1588  carbon storage regulator, CsrA  43.66 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2239  carbon storage regulator, CsrA  40.58 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5234  carbon storage regulator, CsrA  33.33 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3093  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  30.56 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1246  carbon storage regulator  48.65 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.215113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1121  carbon storage regulator  48.65 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0619  carbon storage regulator  48.65 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.760679  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0211  carbon storage regulator, CsrA  40.32 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.363506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0627  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  35.94 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000917661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3224  carbon storage regulator  44.59 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3470  carbon storage regulator  50 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0311  carbon storage regulator  41.82 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0440  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  41.43 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2401  carbon storage regulator, CsrA  37.93 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2998  carbon storage regulator  44.9 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3041  carbon storage regulator  39.19 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31000  carbon storage regulator CsrA  34.43 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0604  carbon storage regulator, CsrA  35.14 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17090  carbon storage regulator, CsrA  46.67 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1912  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  48.08 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0207857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0884  carbon storage regulator, CsrA  35.59 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0391  carbon storage regulator  40 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0184  carbon storage regulator  41.38 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3150  carbon storage regulator  35.82 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2526  carbon storage regulator, CsrA  35.82 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1462  carbon storage regulator  29.63 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365712  hitchhiker  0.0000230945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1640  carbon storage regulator  29.63 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  hitchhiker  0.000536973 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1613  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000487274  hitchhiker  0.00000000608552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2901  carbon storage regulator  36.84 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.748507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0845  carbon storage regulator  42.59 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0820  carbon storage regulator  42.59 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52570  carbon storage regulator  38.89 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0097749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4610  carbon storage regulator  38.89 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1999  carbon storage regulator, CsrA  39.66 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1291  carbon storage regulator, CsrA  34.38 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341556  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0928  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1301  carbon storage regulator  32.81 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000114714  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0102  carbon storage regulator  31.82 
 
 		 71 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0088  carbon storage regulator  31.82 
 
 		 71 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1612  carbon storage regulator, CsrA  36.36 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.734443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3832  carbon storage regulator  42.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1479  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  35.19 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0325311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1651  carbon storage regulator, CsrA  35.19 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02546  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000022346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0993  carbon storage regulator, CsrA  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000137692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3012  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00129826  hitchhiker  0.0000233045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3942  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000017158  normal  0.528243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3028  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000946533  decreased coverage  0.00000698794 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00146  carbon storage regulator  31.82 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2977  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000628475  decreased coverage  0.0000534351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1214  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424179  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02511  hypothetical protein  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000557514  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2970  carbon storage regulator, CsrA  50 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3171  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000051155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2945  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1938  carbon storage regulator  42.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3181  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000800823  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2832  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.37638e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2979  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000170939  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3547  carbon storage regulator  42.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3135  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000287741  hitchhiker  0.000767702 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1016  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000119798  hitchhiker  0.00141183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2818  carbon storage regulator  33.9 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306437  hitchhiker  0.000110428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3201  carbon storage regulator  42.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.481754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3566  carbon storage regulator  44.64 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.054152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3339  carbon storage regulator  44.64 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114105  hitchhiker  0.000524878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3237  carbon storage regulator  32.2 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000628305  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1511  carbon storage regulator, CsrA  34.57 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3372  carbon storage regulator  32.2 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0750  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  46.81 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.708903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0999  carbon storage regulator  32.2 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0984  carbon storage regulator  32.2 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00625603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3210  carbon storage regulator  32.2 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00230567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>