134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1121 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1246  carbon storage regulator  100 
 
 		 75 aa  143  6e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.215113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1121  carbon storage regulator  100 
 
 		 75 aa  143  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0619  carbon storage regulator  100 
 
 		 75 aa  143  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.760679  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1058  carbon storage regulator  82.67 
 
 		 75 aa  118  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0714  carbon storage regulator  54.67 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0062  carbon storage regulator  45.95 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0439  carbon storage regulator, CsrA  55.17 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1631  carbon storage regulator  46.05 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.635349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0669  carbon storage regulator, CsrA  49.3 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0307434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1669  carbon storage regulator, CsrA  50.85 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2278  carbon storage regulator  63.27 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2417  carbon storage regulator, CsrA  55.93 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2232  carbon storage regulator  45.33 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000917827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0246  carbon storage regulator, CsrA  49.23 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0697  carbon storage regulator  48.65 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3470  carbon storage regulator  54 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.699111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0196  carbon storage regulator  44.07 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0668  carbon storage regulator, CsrA  43.1 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0099  carbon storage regulator, CsrA  38.89 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1511  carbon storage regulator, CsrA  46.38 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2239  carbon storage regulator, CsrA  52.73 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0604  carbon storage regulator, CsrA  32 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0614  carbon storage regulator, CsrA  46.55 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4097  carbon storage regulator, CsrA  42.03 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0309  carbon storage regulator, CsrA  43.66 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0388  carbon storage regulator, CsrA  44.44 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224817  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0673  carbon storage regulator, CsrA  43.48 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0697  carbon storage regulator, CsrA  43.48 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000794724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5234  carbon storage regulator, CsrA  41.38 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2998  carbon storage regulator  44.9 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0772  carbon storage regulator  28.77 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31000  carbon storage regulator CsrA  36.51 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2005  carbon storage regulator, CsrA  38.67 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17090  carbon storage regulator, CsrA  42.62 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0019  carbon storage regulator, CsrA  35.38 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1147  global regulator protein CsrA  37.33 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0184  carbon storage regulator  40.32 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0311  carbon storage regulator  38.98 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0211  carbon storage regulator, CsrA  41.82 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.363506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0440  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  45.45 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0884  carbon storage regulator, CsrA  44.68 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0992  carbon storage regulator, CsrA  39.29 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3041  carbon storage regulator  43.64 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3150  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 78 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3224  carbon storage regulator  39.73 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0885  carbon storage regulator  40.68 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.4873100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1338  carbon storage regulator, CsrA  33.96 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0992  carbon storage regulator  39.29 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000161482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3026  carbon storage regulator  38.36 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1588  carbon storage regulator, CsrA  41.67 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2420  carbon storage regulator, CsrA  41.82 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1612  carbon storage regulator, CsrA  34.55 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.734443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2360  carbon storage regulator, CsrA  28.77 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1462  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365712  hitchhiker  0.0000230945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1912  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  42.31 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0207857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0627  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  34.48 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000917661  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1640  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  hitchhiker  0.000536973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1677  carbon storage regulator, CsrA  28.99 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322482  normal  0.92927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1296  carbon storage regulator, CsrA  38.46 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.760473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1746  carbon storage regulator, CsrA  36.54 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2355  carbon storage regulator  41.94 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3943  carbon storage regulator, putative  44.68 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1214  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3968  carbon storage regulator, CsrA  36.54 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934134  normal  0.143623 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1613  carbon storage regulator  31.48 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000487274  hitchhiker  0.00000000608552 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0390  carbon storage regulator, CsrA  43.55 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1291  carbon storage regulator, CsrA  35.19 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2526  carbon storage regulator, CsrA  34.55 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1999  carbon storage regulator, CsrA  35.59 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0967  carbon storage regulator, CsrA  35.19 
 
 		 65 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00770728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00146  carbon storage regulator  34.62 
 
 		 70 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0391  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52570  carbon storage regulator  31.48 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0097749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1050  carbon storage regulator  32.76 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000586166  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2901  carbon storage regulator  31.48 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.748507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4610  carbon storage regulator  31.48 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3427  carbon storage regulator  43.4 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.067647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0455  carbon storage regulator, CsrA  56.45 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4191  carbon storage regulator, CsrA  35.94 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1478  carbon storage regulator, CsrA  39.29 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0750  carbon storage regulator, CsrA / carbon storage regulator, CsrA  43.75 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.708903 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0341  carbon storage regulator  51.06 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1319  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138416  hitchhiker  0.00721539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2401  carbon storage regulator, CsrA  34.55 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3338  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0466737  hitchhiker  0.0000666131 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1479  carbon storage regulator, CsrA  34.62 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0228801  normal  0.253432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3210  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00230567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3426  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1129  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000102923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1200  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1064  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.998341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1130  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3113  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2743  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000840228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0984  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00625603  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3122  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000135841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3237  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000628305  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3372  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0999  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1117  carbon storage regulator  33.33 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00529812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>