More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0221 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1484  inner membrane protein YicO  82.03 
 
 
430 aa  701    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0221  inner membrane protein YicO  100 
 
 
443 aa  863    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1685  Xanthine/uracil/vitamin C permease  66.36 
 
 
429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0583  xanthine/uracil permease family protein  61.7 
 
 
443 aa  553  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.628445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0399  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.7 
 
 
428 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0428  xanthine/uracil permease family protein  57.66 
 
 
440 aa  508  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1372  xanthine/uracil permease family protein  58.24 
 
 
439 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0281  xanthine/uracil permease family protein  58.24 
 
 
439 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1561  xanthine/uracil permease family protein  58.18 
 
 
439 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  45.98 
 
 
428 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.84 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.93 
 
 
431 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  44.13 
 
 
429 aa  335  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.51 
 
 
441 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.46 
 
 
431 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.84 
 
 
429 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.46 
 
 
431 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.84 
 
 
429 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.84 
 
 
429 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.84 
 
 
429 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  43.46 
 
 
429 aa  332  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.9 
 
 
429 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.9 
 
 
429 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.66 
 
 
429 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.99 
 
 
431 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.54 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  42.52 
 
 
431 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.69 
 
 
429 aa  324  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.11 
 
 
434 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.11 
 
 
434 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.72 
 
 
429 aa  323  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.78 
 
 
429 aa  322  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.55 
 
 
433 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.78 
 
 
429 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  41.96 
 
 
431 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.31 
 
 
433 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 
431 aa  319  7e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.72 
 
 
440 aa  318  9e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  41.72 
 
 
431 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.55 
 
 
429 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.14 
 
 
433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.62 
 
 
431 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.38 
 
 
429 aa  312  9e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  40.14 
 
 
434 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.43 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.92 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.28 
 
 
453 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  42.42 
 
 
430 aa  310  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  42.39 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  40.87 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  41.92 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  41.33 
 
 
430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.55 
 
 
460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.34 
 
 
432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.54 
 
 
454 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  41.71 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.76 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.76 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.57 
 
 
433 aa  300  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  39.62 
 
 
453 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.03 
 
 
433 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.32 
 
 
443 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.19 
 
 
431 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  41.94 
 
 
494 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.2 
 
 
431 aa  299  5e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.14 
 
 
430 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.03 
 
 
433 aa  299  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.48 
 
 
446 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.86 
 
 
432 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  38.83 
 
 
433 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.23 
 
 
436 aa  297  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.52 
 
 
441 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.22 
 
 
438 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  37.56 
 
 
433 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1528  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.9 
 
 
440 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000884717  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B22  putative guanine/xanthine permease  40.5 
 
 
451 aa  296  6e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.08 
 
 
433 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.44 
 
 
446 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  39.11 
 
 
453 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.59 
 
 
433 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.27 
 
 
430 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.42 
 
 
442 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  38.86 
 
 
465 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  37.41 
 
 
445 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.59 
 
 
433 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.59 
 
 
433 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.59 
 
 
433 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.67 
 
 
437 aa  293  5e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  37.18 
 
 
445 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  37.18 
 
 
445 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.59 
 
 
433 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  37.18 
 
 
445 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  39.36 
 
 
433 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  39.36 
 
 
433 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  39.36 
 
 
433 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  39.14 
 
 
465 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.76 
 
 
446 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.52 
 
 
446 aa  290  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  38.88 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>