38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11983 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  40.48 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  38.05 
 
 
192 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  35.07 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  32.38 
 
 
188 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  34.5 
 
 
199 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11978  hypothetical protein  37.32 
 
 
189 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  31.63 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  34.92 
 
 
200 aa  91.3  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  35.29 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0613  hypothetical protein  30.37 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  30.05 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  29.91 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  30.88 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  34.51 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1082  hypothetical protein  26.48 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  26.94 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4184  hypothetical protein  28.3 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  24.65 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0864  hypothetical protein  29.54 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2106  hypothetical protein  26.96 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.713081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0939  hypothetical protein  25.21 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000126087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3350  hypothetical protein  26.16 
 
 
257 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  26.51 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4983  hypothetical protein  28.22 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.977283  hitchhiker  0.00116918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0866  hypothetical protein  23.93 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3627  hypothetical protein  30.5 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.570634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2238  hypothetical protein  24.87 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575909  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5362  hypothetical protein  25.58 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141407  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4771  secreted protein  30.93 
 
 
237 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218877 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1948  hypothetical protein  25.68 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.840163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2544  hypothetical protein  24.55 
 
 
257 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0865  hypothetical protein  26.48 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0675  hypothetical protein  25 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1533  hypothetical protein  31.78 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2253  hypothetical protein  27.19 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289772  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0779  hypothetical protein  22.29 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1405  hypothetical protein  31.3 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>