26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08301 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  655    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  48.86 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2161  Abortive infection protein  52.94 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.646746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  30.26 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  27.84 
 
 		 293 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0099  abortive infection protein  28.37 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0139608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  24.8 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  25.36 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  26.72 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  31.25 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  31.09 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  31.93 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0130  abortive infection protein  27.92 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  33.03 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5786  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  31.43 
 
 		 400 aa  46.2  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4640  abortive infection protein  28.14 
 
 		 311 aa  45.8  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  35.37 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  32.1 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  31.86 
 
 		 419 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  40 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  28.83 
 
 		 220 aa  42.7  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0088  CAAX amino terminal protease family protein  35.37 
 
 		 182 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  28.42 
 
 		 236 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  28.42 
 
 		 236 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  28.42 
 
 		 236 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>