65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04470 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  274  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  30.37 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.51 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  29.1 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.57 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  29.57 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  34.52 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  34.58 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  35 
 
 
281 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.28 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.5 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.5 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  29.71 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.5 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.57 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.78 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.44 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.5 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.44 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.44 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.99 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.25 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  28.44 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35 
 
 
305 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.13 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.71 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.71 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.71 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.5 
 
 
273 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.14 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.9 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.78 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.99 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.96 
 
 
181 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.17 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.91 
 
 
204 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  33.75 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.78 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 
524 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.64 
 
 
221 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0706  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.99 
 
 
267 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.24 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.9 
 
 
181 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.87 
 
 
351 aa  43.5  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  24.43 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.99 
 
 
397 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.56 
 
 
274 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  34.38 
 
 
267 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.93 
 
 
279 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.56 
 
 
280 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  34.38 
 
 
297 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.58 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2782  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.76 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.3452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.35 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2838  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.45 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.74 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  30.69 
 
 
478 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.69 
 
 
478 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.77 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.43 
 
 
241 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.47 
 
 
263 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  23.85 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.57 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>