47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00995 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00995  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  275  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2380  OsmC family protein  60.61 
 
 
133 aa  170  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0647  OsmC family protein  56.49 
 
 
137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0556  hypothetical protein  58.54 
 
 
136 aa  155  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0566  hypothetical protein  54.33 
 
 
136 aa  152  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.838093  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0515  OsmC family protein  53.79 
 
 
134 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0859672  normal  0.078618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1698  OsmC family protein  44.88 
 
 
136 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0342  OsmC family protein  49.23 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.720795  normal  0.012657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3187  hypothetical protein  52.71 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0444  OsmC family protein  48.51 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10251  redox protein, regulator of disulfide bond formation  44.8 
 
 
135 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0946  putative redox protein  41.27 
 
 
131 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4047  OsmC family protein  40.91 
 
 
137 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.325881  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15411  redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.84 
 
 
306 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0845  OsmC family protein  39.17 
 
 
132 aa  94.4  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0344874 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11241  putative stress-induced protein OsmC  39.06 
 
 
135 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1036  putative stress-induced protein OsmC  38.28 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347176  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15061  redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.2 
 
 
320 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0738856  normal  0.127716 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11251  putative stress-induced protein OsmC  36.72 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0937  redox protein  35.54 
 
 
122 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.393719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17941  hypothetical protein  34.71 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1538  OsmC family protein  31.3 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000238366  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  31.25 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  32.41 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5966  OsmC family protein  32.04 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.136063  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  30.51 
 
 
248 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  30.36 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5976  OsmC family protein  25.23 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  23.81 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0976  OsmC family protein  29.03 
 
 
118 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  26.42 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  24.55 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  27.03 
 
 
407 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  25.23 
 
 
406 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  25.21 
 
 
415 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  28.57 
 
 
410 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  26.52 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  28 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  26.85 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  25 
 
 
408 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  25 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  24.3 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  28.81 
 
 
410 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2314  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  24.3 
 
 
185 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  24.41 
 
 
134 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  24.04 
 
 
408 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2818  OsmC-like protein  20.41 
 
 
138 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>