More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3500 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  100 
 
 
279 aa  554  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0997  ABC transporter related  94.05 
 
 
280 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2211  ABC transporter related  76.6 
 
 
269 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  74.1 
 
 
271 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0836  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  79.12 
 
 
276 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1037  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  73.95 
 
 
640 aa  357  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.242252  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5785  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  74.9 
 
 
271 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0687  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  73.95 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1190  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  71.22 
 
 
289 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1637  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  73.95 
 
 
276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1030  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  73.95 
 
 
276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2325  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  73.95 
 
 
276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.368958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2961  cobalamin ABC transporter, ATP-binding protein  73.95 
 
 
276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2502  ABC transporter related  73.71 
 
 
270 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2370  ABC transporter related  73.71 
 
 
270 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722113  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2459  ABC transporter related  73.28 
 
 
272 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1843  ABC transporter related  73.68 
 
 
272 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2454  ABC transporter related  73.68 
 
 
272 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  50.2 
 
 
281 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2207  ABC transporter related  52.44 
 
 
279 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.215656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0656  ABC transporter related  51.54 
 
 
278 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3755  ABC transporter related  50.59 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2787  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.894018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2398  ABC transporter ATP-binding protein  51.61 
 
 
279 aa  198  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4032  ABC transporter related  44.71 
 
 
257 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3202  ATP-binding ABC transporter protein  39.68 
 
 
254 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1921  ABC transporter related  42.69 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0253  ABC transporter related  47.67 
 
 
257 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  38.46 
 
 
274 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  38.43 
 
 
271 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 
270 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 
270 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.18 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  38.18 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  38.18 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 
270 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 
270 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  42.79 
 
 
259 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  38.64 
 
 
275 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  39.77 
 
 
267 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  38.68 
 
 
263 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  38.64 
 
 
264 aa  158  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1576  ABC transporter related  40.91 
 
 
257 aa  158  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.789934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 
270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  37.14 
 
 
267 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  37.73 
 
 
270 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  39.24 
 
 
285 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  37.59 
 
 
292 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  37.4 
 
 
271 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1462  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
284 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.12 
 
 
264 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
279 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  43.17 
 
 
267 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.65 
 
 
255 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  39.46 
 
 
303 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  39.22 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1050  ABC transporter related protein  37.4 
 
 
263 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  34.73 
 
 
254 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.96 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  36.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.21 
 
 
266 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  36.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  36.29 
 
 
275 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  41.78 
 
 
274 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.35 
 
 
268 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.03 
 
 
264 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 
262 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.3 
 
 
271 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.03 
 
 
264 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
270 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.03 
 
 
264 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  32.92 
 
 
265 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  32.92 
 
 
265 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
272 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0276  ABC transporter related  42.2 
 
 
264 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.29 
 
 
274 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  36.29 
 
 
274 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 
251 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.9 
 
 
251 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
273 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  33.59 
 
 
267 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  30.08 
 
 
258 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  40.57 
 
 
249 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  35.98 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  35.63 
 
 
265 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  33.62 
 
 
252 aa  149  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  35.47 
 
 
284 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  35.25 
 
 
285 aa  148  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 
264 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 
264 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  36.29 
 
 
275 aa  148  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>