21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2974 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  41.89 
 
 		 1343 aa  925    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  80.66 
 
 		 1327 aa  2113    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 1306 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  41.26 
 
 		 1332 aa  894    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  100 
 
 		 1332 aa  2675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  37.36 
 
 		 1368 aa  798    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 1296 aa  332  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5545  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 1279 aa  318  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1345 aa  311  4e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1964  hypothetical protein  24.95 
 
 		 944 aa  197  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.144007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3205  hypothetical protein  28.5 
 
 		 942 aa  154  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2441  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1190 aa  146  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1193 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1193 aa  92  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0537  hypothetical protein  24.82 
 
 		 942 aa  92  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00112952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1249 aa  82.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3206  putative signal peptide protein  49.46 
 
 		 299 aa  80.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1646  hypothetical protein  22.92 
 
 		 755 aa  75.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.557142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1963  putative signal peptide protein  35.8 
 
 		 299 aa  50.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.789583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  25.54 
 
 		 574 aa  45.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0536  hypothetical protein  21.23 
 
 		 387 aa  45.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.120824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>