36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4520 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  81.21 
 
 		 298 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  55.39 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3351  hypothetical protein  55.15 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824985  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3429  putative signal peptide  46.46 
 
 		 312 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2099  putative signal peptide  45.85 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00558021  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1344  putative signal peptide  40.41 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3246  putative signal peptide  40.91 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5137  hypothetical protein  49.53 
 
 		 282 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  38.54 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  40.07 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5058  putative signal peptide  39.36 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0192886  normal  0.0905657 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  38.87 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  38.54 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1259  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  38.87 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0181867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  38.46 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  38.11 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  38.11 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3742  putative phenol degradation enzyme  35.29 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3016  phenol degradation enzyme  34.93 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0548  hypothetical protein  49.67 
 
 		 152 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0826434  hitchhiker  0.00673364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  31.18 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2846  hypothetical protein  31.94 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0551  hypothetical protein  54.78 
 
 		 151 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319027  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15280  hypothetical protein  28.26 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0013273  hitchhiker  0.000000000000157451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1344  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  24.83 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0486  hypothetical protein  29.1 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0628681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  24.01 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  25.77 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  25.09 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  24.32 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  24.9 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  25.48 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>