20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1541 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  853    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  49.27 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  30.62 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  28.08 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  26.87 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  27.59 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  28.87 
 
 		 549 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  28.66 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2345  hypothetical protein  27.36 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  24.65 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06330  hypothetical protein  22.71 
 
 		 330 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  27.52 
 
 		 454 aa  53.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  23.3 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3174  hypothetical protein  26.14 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3236  hypothetical protein  26.14 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3186  hypothetical protein  26.14 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7322  hypothetical protein  25.33 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.33936  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  27.2 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0112  hypothetical protein  27.52 
 
 		 478 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000000224966  decreased coverage  0.000517302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1232  hypothetical protein  26.62 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.583385  normal  0.276368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>