More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7647 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  100 
 
 
291 aa  587  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  88.61 
 
 
301 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  87.37 
 
 
304 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  88.81 
 
 
304 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  88.81 
 
 
304 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  86.62 
 
 
304 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  88.81 
 
 
304 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  86.41 
 
 
304 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  76.66 
 
 
297 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  81.05 
 
 
293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  80.35 
 
 
293 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  80.35 
 
 
293 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  80 
 
 
293 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  79.65 
 
 
293 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  79.65 
 
 
293 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  79.65 
 
 
293 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  79.65 
 
 
293 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  77.58 
 
 
292 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  76.34 
 
 
296 aa  427  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  53.36 
 
 
285 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  56.16 
 
 
277 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  53.71 
 
 
297 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  54.8 
 
 
287 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  56 
 
 
276 aa  295  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  53.41 
 
 
285 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  53.82 
 
 
279 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  56 
 
 
276 aa  292  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  56.32 
 
 
277 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  53.05 
 
 
295 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  52.69 
 
 
295 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  55.96 
 
 
277 aa  289  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  55.96 
 
 
277 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  54.87 
 
 
277 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  53.71 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  55.56 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  52.71 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
279 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  53.99 
 
 
276 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  53.05 
 
 
280 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  53.62 
 
 
279 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  52.71 
 
 
284 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  55.43 
 
 
276 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  55.07 
 
 
276 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.71 
 
 
291 aa  272  6e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  54.55 
 
 
274 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  54.55 
 
 
274 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  54.55 
 
 
274 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  49.3 
 
 
291 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.54 
 
 
325 aa  235  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  50.36 
 
 
281 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.25 
 
 
650 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  48.72 
 
 
545 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0671  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.81 
 
 
321 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642349  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 
333 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  42.55 
 
 
283 aa  225  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1079  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 
345 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233153  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1009  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 
341 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 
336 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  48.86 
 
 
566 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0951  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4407  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.01 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  48.91 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 
357 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  47.51 
 
 
537 aa  219  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.35 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.51 
 
 
351 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3037  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.13 
 
 
332 aa  218  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
334 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  46.74 
 
 
274 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.95 
 
 
553 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
353 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 
703 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 
343 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  45.95 
 
 
543 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  47.94 
 
 
276 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.68 
 
 
337 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.276741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0185  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
334 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  46.52 
 
 
545 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.71 
 
 
329 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 
340 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6389  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 
332 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003660  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  44.89 
 
 
327 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.42 
 
 
333 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 
325 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.00444636 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1733  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 
338 aa  217  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5119  putative ABC transporter ATP-binding  46.54 
 
 
327 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  0.157884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1864  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.91 
 
 
350 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429685  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  45.95 
 
 
543 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
548 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1951  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.8 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2969  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.46 
 
 
341 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.623944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2911  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 
334 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2428  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.36 
 
 
332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 
332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538334  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3042  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 
332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.06 
 
 
353 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5164  ABC transporter related  45.21 
 
 
304 aa  214  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0258  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.53 
 
 
369 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21107  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
330 aa  215  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>