More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6214 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
978 aa  2036    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  81.14 
 
 
978 aa  1664    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  84.34 
 
 
978 aa  1739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  55.16 
 
 
958 aa  1072    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  84.34 
 
 
978 aa  1741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  80.7 
 
 
978 aa  1667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  55.08 
 
 
968 aa  1055    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  71.17 
 
 
969 aa  1441    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  49.47 
 
 
932 aa  884    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  70.65 
 
 
953 aa  1415    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  83.04 
 
 
974 aa  1714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  69.46 
 
 
981 aa  1391    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.67 
 
 
974 aa  1025    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  50 
 
 
928 aa  862    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  50.59 
 
 
935 aa  922    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  63.49 
 
 
961 aa  1282    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  82.64 
 
 
974 aa  1705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  84.24 
 
 
973 aa  1738    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  66.77 
 
 
979 aa  1341    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  54.5 
 
 
973 aa  1000    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  69.29 
 
 
981 aa  1377    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  84.34 
 
 
973 aa  1739    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  84.34 
 
 
973 aa  1741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  84.34 
 
 
973 aa  1739    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  84.34 
 
 
973 aa  1739    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.22 
 
 
923 aa  810    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.15 
 
 
833 aa  220  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  25.61 
 
 
858 aa  202  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  28.19 
 
 
812 aa  187  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 
930 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  29.2 
 
 
1426 aa  184  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  31.96 
 
 
1434 aa  183  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  27.57 
 
 
817 aa  181  8e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.64 
 
 
839 aa  179  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
837 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  25.94 
 
 
928 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  24.91 
 
 
807 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
927 aa  173  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  24.19 
 
 
910 aa  173  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 
932 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.2 
 
 
864 aa  169  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  25.44 
 
 
803 aa  168  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  26.2 
 
 
909 aa  167  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 
781 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 
911 aa  164  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 
856 aa  164  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  23.07 
 
 
934 aa  161  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 
803 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  21.6 
 
 
992 aa  158  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  23.31 
 
 
855 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  24.08 
 
 
856 aa  157  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  22.87 
 
 
917 aa  157  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 
938 aa  155  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  24.65 
 
 
1029 aa  152  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  23.49 
 
 
1155 aa  150  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  30.83 
 
 
800 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 
805 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  34.65 
 
 
722 aa  149  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  26.9 
 
 
805 aa  148  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.49 
 
 
836 aa  147  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 
1148 aa  147  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  23.15 
 
 
826 aa  146  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  25.86 
 
 
1087 aa  144  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  21.69 
 
 
843 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.01 
 
 
814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 
765 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.01 
 
 
814 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.84 
 
 
814 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  22.46 
 
 
1017 aa  143  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  23.55 
 
 
854 aa  141  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  23.55 
 
 
854 aa  141  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.01 
 
 
814 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  24.72 
 
 
1031 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
916 aa  140  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  25 
 
 
909 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  22.22 
 
 
851 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  29.1 
 
 
789 aa  138  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  34.47 
 
 
759 aa  137  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
777 aa  136  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  25.74 
 
 
799 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  21.35 
 
 
971 aa  135  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  24.48 
 
 
800 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 
1020 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 
1020 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  23.91 
 
 
1022 aa  134  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  25.17 
 
 
1020 aa  134  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  24.01 
 
 
1038 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.54 
 
 
814 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  27.7 
 
 
784 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27730  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.79 
 
 
801 aa  132  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.953321  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  24.54 
 
 
814 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  22.44 
 
 
817 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  24.54 
 
 
814 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.54 
 
 
814 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.08 
 
 
814 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.54 
 
 
814 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.54 
 
 
814 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.96 
 
 
814 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  24.9 
 
 
1020 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.96 
 
 
814 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>