231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6014 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2763  ATP-grasp domain protein  79.77 
 
 
431 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6014  ATP-grasp domain-containing protein  100 
 
 
432 aa  893    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3639  ATP-grasp domain-containing protein  68.72 
 
 
424 aa  602  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00395408  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0305  ATP citrate lyase subunit 1  49.06 
 
 
423 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1267  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  28.88 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1056  ATP citrate synthase, subunit 1  24.39 
 
 
435 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00742266  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02435  citrate lyase subunit (Eurofung)  24.18 
 
 
485 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.031235  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.84 
 
 
396 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00800  conserved hypothetical protein  21.34 
 
 
1149 aa  73.6  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.49 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.56 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0516  Fis family transcriptional regulator  24.03 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0074  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.81 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.698704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.49 
 
 
386 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2334  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit / succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  24.66 
 
 
700 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.530303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.73 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  26.05 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.18 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  29.89 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  29.33 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1836  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  25.83 
 
 
689 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.11 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  30.08 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.14 
 
 
389 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07000  succinyl-CoA synthetase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04520)  26.67 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0570406  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0397  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  24.62 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.254112  normal  0.0232854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.88 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1307  ATP citrate lyase subunit 1  22.08 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.810397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0191  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  25.34 
 
 
372 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  26.78 
 
 
387 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.91 
 
 
385 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0545  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  24.42 
 
 
696 aa  60.1  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.81 
 
 
386 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25 
 
 
375 aa  59.7  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.2 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  23.12 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1831  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.74 
 
 
389 aa  59.7  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1716  malate--CoA ligase subunit beta  23.67 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.2 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.44 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.88 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.88 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  27.59 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.39 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.88 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.2 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  27.31 
 
 
386 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.2 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.56 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.55 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.19 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.19 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.3 
 
 
388 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.63 
 
 
392 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.57 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0604  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.81 
 
 
392 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0558  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.95 
 
 
387 aa  57  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.679932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  29.63 
 
 
390 aa  56.6  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.59 
 
 
388 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3089  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  24.65 
 
 
425 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000498843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1703  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.15 
 
 
388 aa  56.6  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213189  normal  0.378528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.2 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.72 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.1 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0570  ATP-dependent citrate lyase beta subunit  22.86 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.1 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.54 
 
 
389 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.54 
 
 
389 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.81 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.87 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.2 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.2 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.95 
 
 
387 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.68 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.49 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.49 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.49 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.49 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0072  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26 
 
 
386 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1392  ATP-grasp domain protein  23.38 
 
 
398 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.62 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4424  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  28 
 
 
387 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.780368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.71 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.71 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25 
 
 
388 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.1 
 
 
388 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.1 
 
 
388 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1716  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.31 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.71 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.71 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.71 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.71 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.71 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1350  ATP-grasp domain protein  22.83 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1397  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.95 
 
 
387 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0380  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.98 
 
 
392 aa  53.9  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.52 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.69 
 
 
387 aa  53.5  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  24.3 
 
 
391 aa  53.5  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>