More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5793 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5793  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
307 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.139483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0972  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  85.43 
 
 
303 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.312001  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2971  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.18 
 
 
301 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4822  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.75 
 
 
294 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429733  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1911  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  45.14 
 
 
294 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.195634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2130  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.28 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424924  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.63 
 
 
299 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1431  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  39.66 
 
 
297 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2586  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  42.71 
 
 
298 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2631  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  42.71 
 
 
298 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7141  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.68 
 
 
303 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1214  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.46 
 
 
303 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.765092  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.38 
 
 
296 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
293 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1968  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.27 
 
 
298 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  32.99 
 
 
296 aa  158  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  33.22 
 
 
296 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  33.22 
 
 
296 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  33.22 
 
 
296 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  33.22 
 
 
296 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  33.22 
 
 
296 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  32.53 
 
 
294 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  32.53 
 
 
294 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  32.53 
 
 
294 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  32.53 
 
 
294 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  32.53 
 
 
294 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  32.53 
 
 
296 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.53 
 
 
296 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  32.53 
 
 
296 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  32.53 
 
 
296 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.68 
 
 
293 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.33 
 
 
297 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.32 
 
 
298 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.31 
 
 
297 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.15 
 
 
289 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.02 
 
 
299 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.31 
 
 
297 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.99 
 
 
297 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4289  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  37.37 
 
 
286 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  33.33 
 
 
294 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.03 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001550  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.67 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.9 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1907  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.46 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00339906  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.3 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.45 
 
 
292 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  33.68 
 
 
294 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.25 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1631  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  39.33 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1371  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.98 
 
 
307 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.22 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0974  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.27 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362107  normal  0.788832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2381  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.28 
 
 
296 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4815  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.43 
 
 
302 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3369  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  33.45 
 
 
303 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00318158  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.74 
 
 
298 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.95 
 
 
296 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.49 
 
 
295 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9609  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.12 
 
 
288 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2319  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.63 
 
 
296 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.47 
 
 
291 aa  143  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0495  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.87 
 
 
295 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3005  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.99 
 
 
296 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.328852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.08 
 
 
299 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.26 
 
 
303 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4518  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.8 
 
 
308 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.431597  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4259  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.67 
 
 
297 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  34.25 
 
 
296 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0783  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.45 
 
 
296 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3216  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.4 
 
 
309 aa  142  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.969854  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.93 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05487  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.33 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.1 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.68 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4543  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.59 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2554  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.47 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0333948  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.2 
 
 
294 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2391  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.12 
 
 
291 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.633873  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.79 
 
 
298 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2454  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.93 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.256523  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2461  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  31.47 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243113  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1587  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.75 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.169784  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.45 
 
 
299 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2192  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.93 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.93 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0387103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2115  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.93 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2353  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.93 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6215  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.56 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0695059  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1728  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.58 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1764  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.12 
 
 
291 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.438738 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.49 
 
 
297 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1721  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.12 
 
 
291 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00783731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  32.3 
 
 
294 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2568  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.47 
 
 
291 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.138617  hitchhiker  0.00176659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1297  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.41 
 
 
294 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.47 
 
 
293 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.48 
 
 
298 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3254  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
290 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.870167  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  32.99 
 
 
290 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>