44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3814 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  76.92 
 
 		 182 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  75.64 
 
 		 182 aa  245  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  88.1 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  73.62 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  87.6 
 
 		 178 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  87.6 
 
 		 178 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  88.5 
 
 		 113 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  42.52 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  37.59 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  37.29 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  40.87 
 
 		 172 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  39.45 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  39.42 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  32.74 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  36.45 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  36.23 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  31.2 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  34.95 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  30.67 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  33.33 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  33.06 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  26.32 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  27.97 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  30.25 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  29.37 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  30.39 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 166 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 166 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  36.05 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 407 aa  42  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  27.4 
 
 		 415 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 149 aa  41.2  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>