22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1875 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1875  putative membrane protein, phage K related  100 
 
 
600 aa  1202    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855752  hitchhiker  0.000000000791061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3052  putative membrane protein, phage K related  38.67 
 
 
574 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00556585  hitchhiker  0.0000266051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  29.87 
 
 
564 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1321  hypothetical protein  41.46 
 
 
983 aa  100  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2411  hypothetical protein  32.32 
 
 
517 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.422595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3119  hypothetical protein  23.85 
 
 
648 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0561  hypothetical protein  21.11 
 
 
727 aa  68.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181281  hitchhiker  0.00000149725 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2014  hypothetical protein  24.19 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979854  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  29.03 
 
 
756 aa  63.9  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  25.32 
 
 
925 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  26.42 
 
 
762 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  22.78 
 
 
811 aa  61.6  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2451  hypothetical protein  33.64 
 
 
1088 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  25.27 
 
 
671 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  25.86 
 
 
715 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1281  hypothetical protein  23.61 
 
 
824 aa  53.9  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  35.64 
 
 
957 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  25.16 
 
 
828 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4009  hypothetical protein  24.59 
 
 
548 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  24.81 
 
 
853 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1236  hypothetical protein  32.86 
 
 
523 aa  43.9  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  22.12 
 
 
701 aa  43.5  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>