42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0335 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  100 
 
 
282 aa  564  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  86.48 
 
 
282 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  84.97 
 
 
287 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  67.13 
 
 
288 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  68.79 
 
 
283 aa  374  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  67.13 
 
 
288 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  66.43 
 
 
288 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  66.43 
 
 
288 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  67.49 
 
 
285 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  66.43 
 
 
285 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  66.08 
 
 
285 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  67.73 
 
 
285 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  67.86 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  67.38 
 
 
285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  67.38 
 
 
285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  67.38 
 
 
285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  67.38 
 
 
285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  67.5 
 
 
285 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  49.2 
 
 
284 aa  234  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  48.63 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 
280 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  46.54 
 
 
283 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
285 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  38.8 
 
 
292 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  46.11 
 
 
192 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  33.58 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  36.04 
 
 
229 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
277 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  32.46 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  35.61 
 
 
357 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  40 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
288 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  34.76 
 
 
319 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  34.3 
 
 
232 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>