30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2360 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2360  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 346 aa  691    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  29.09 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  29.24 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  26.05 
 
 		 232 aa  52.8  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  27.12 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  28.45 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  32.69 
 
 		 262 aa  49.3  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  26.34 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  27.66 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  27.1 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.34 
 
 		 1001 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 417 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  27.03 
 
 		 292 aa  46.2  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1849  hypothetical protein  29.13 
 
 		 297 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  27.87 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1023 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  25.69 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  29.81 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  24.55 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.71 
 
 		 1000 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  26.61 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  22.41 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  22.22 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 242 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>