40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4234 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  66.55 
 
 
636 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  65.83 
 
 
571 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  83.89 
 
 
576 aa  924    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  70.27 
 
 
564 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  85.82 
 
 
564 aa  943    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  85.64 
 
 
564 aa  951    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  69.96 
 
 
566 aa  751    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  67.02 
 
 
623 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  100 
 
 
567 aa  1130    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  86.52 
 
 
564 aa  966    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  70.45 
 
 
564 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  85.11 
 
 
564 aa  933    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  70.45 
 
 
564 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  86.52 
 
 
564 aa  966    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  54.64 
 
 
576 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  54.15 
 
 
567 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  59.09 
 
 
558 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  53.26 
 
 
550 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  55.7 
 
 
549 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  56.2 
 
 
558 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  53.89 
 
 
547 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  56.04 
 
 
561 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  53.8 
 
 
552 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  50.55 
 
 
549 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  55.73 
 
 
561 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  48.8 
 
 
549 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  50.09 
 
 
549 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  49.91 
 
 
549 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  53.32 
 
 
579 aa  478  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  45.84 
 
 
566 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  32.3 
 
 
537 aa  223  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  31.38 
 
 
537 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  31.25 
 
 
600 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  28.48 
 
 
643 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  28.37 
 
 
578 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  26.83 
 
 
578 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  26.44 
 
 
720 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.95 
 
 
715 aa  86.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
988 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.03 
 
 
769 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>