39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3585 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  100 
 
 
113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  94.69 
 
 
178 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  93.81 
 
 
182 aa  220  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  93.81 
 
 
178 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  93.81 
 
 
178 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  92.92 
 
 
181 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  92.04 
 
 
182 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  88.5 
 
 
183 aa  213  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  49.06 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  43.27 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  41.35 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  39.81 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  42.27 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  40.82 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  42 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  38.24 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  38.83 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  34.69 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  38.54 
 
 
166 aa  57.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  33.04 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  31.9 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  32.46 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  31.25 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  34.65 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  36.19 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  34.31 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  31.4 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  33.62 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  34.65 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  33.33 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  30.58 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  30.58 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  30.58 
 
 
166 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  29.75 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  30 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  30.28 
 
 
166 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  30.91 
 
 
166 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 
516 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>