49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1511 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  323  8.000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  63.83 
 
 
175 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  55.32 
 
 
191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  45.7 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  40.28 
 
 
178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  53.68 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5296  hypothetical protein  41.3 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5563  hypothetical protein  41.3 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  30.25 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6546  hypothetical protein  51.52 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3876  hypothetical protein  47.06 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  30.53 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  29.13 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1181  hypothetical protein  41.67 
 
 
85 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.120079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  28.69 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  27.87 
 
 
176 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  27.42 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  29.01 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  31.71 
 
 
141 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  26.87 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  28.24 
 
 
138 aa  51.6  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  25.2 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  23.75 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  26.72 
 
 
146 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  25.81 
 
 
148 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  27.27 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  25 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  30.68 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  25 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  30.68 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  25.53 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  21.71 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  26.06 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  26.09 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  30.68 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  29.55 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  28.12 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  24.06 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  32.65 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  28.23 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  19.38 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>