34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30260 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30260  Peptidase M66  100 
 
 		 1056 aa  2119    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  37.62 
 
 		 985 aa  243  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1129  TagA-related protein  36.65 
 
 		 1247 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000117742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0345  ToxR-activated gene A protein  34.32 
 
 		 1013 aa  230  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0001  hypothetical protein  34.66 
 
 		 898 aa  173  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362485  normal  0.442936 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4488  hypothetical protein  36.5 
 
 		 885 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4351  hypothetical protein  36.5 
 
 		 885 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000110268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02169  hypothetical protein  39.64 
 
 		 214 aa  122  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  40.35 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  36.94 
 
 		 2449 aa  72.8  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  32.04 
 
 		 3409 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02167  hypothetical protein  33.33 
 
 		 671 aa  62  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02172  hypothetical protein  38 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  32.12 
 
 		 2397 aa  58.2  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0262  hypothetical protein  24.1 
 
 		 729 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1784  hypothetical protein  24.1 
 
 		 687 aa  55.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1698  hypothetical protein  24.1 
 
 		 687 aa  55.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  31.79 
 
 		 3472 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0112  hypothetical protein  24.1 
 
 		 687 aa  55.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.419147  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1281  hypothetical protein  24.1 
 
 		 687 aa  55.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  31.79 
 
 		 3471 aa  55.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0314  hypothetical protein  24.1 
 
 		 629 aa  54.7  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  31.79 
 
 		 3521 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1111  hypothetical protein  24.1 
 
 		 604 aa  53.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.835196  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  31.75 
 
 		 1859 aa  51.6  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  39.19 
 
 		 606 aa  50.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  40.3 
 
 		 1172 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  52.63 
 
 		 1594 aa  49.7  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0943  adhesion exoprotein  50 
 
 		 979 aa  49.3  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3966  hypothetical protein  24.87 
 
 		 821 aa  48.9  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835095  hitchhiker  0.00682944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0638  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  43.86 
 
 		 1407 aa  47.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.652963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.46 
 
 		 1781 aa  45.4  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2573  cell wall anchor domain-containing protein  26.92 
 
 		 987 aa  45.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2521  cell wall anchor domain-containing protein  26.92 
 
 		 987 aa  45.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>