215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  100 
 
 		 167 aa  319  9.000000000000001e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  63.25 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  71.24 
 
 		 157 aa  201  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  69.18 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  67.81 
 
 		 152 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  68 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  62.84 
 
 		 151 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  62.87 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  60.14 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  52.35 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  60.76 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  65.07 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  63.77 
 
 		 153 aa  168  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  65.75 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  65.22 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  67.12 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  64.38 
 
 		 154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  53.42 
 
 		 152 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  63.5 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  63.5 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  63.5 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  68 
 
 		 151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  59.86 
 
 		 151 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  57.82 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  63.51 
 
 		 163 aa  160  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  64.75 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  59.87 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  65.25 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  67.38 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  68.49 
 
 		 152 aa  158  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  68.71 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  64.23 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  56.46 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  56.58 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  56.67 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  60.27 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  49.67 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  52.29 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 155 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3096  Endoribonuclease L-PSP  63.35 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000584514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  49.36 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  59.33 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  57.93 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  44.22 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  48.32 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  60.4 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  48.32 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  46.79 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  51.66 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  56.16 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  51.03 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  47.68 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  48.34 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  48.34 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  48.34 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  48.34 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  49.33 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  46.41 
 
 		 409 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  45.33 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  47.4 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  59.06 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  42.18 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  46.05 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  50.67 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  45.64 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>