42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16960  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.365163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  33.46 
 
 
510 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  36.53 
 
 
512 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  35.53 
 
 
522 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  32.12 
 
 
539 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  33.45 
 
 
519 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  32.16 
 
 
508 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  32.71 
 
 
508 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  30.64 
 
 
513 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  31.48 
 
 
719 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  32.56 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  31.03 
 
 
527 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  31.88 
 
 
492 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  26.47 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  26.62 
 
 
509 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  23.83 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  30.71 
 
 
490 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  27.92 
 
 
502 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  27.92 
 
 
502 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  27.92 
 
 
502 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  31.82 
 
 
510 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  30.45 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  31.58 
 
 
721 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  27.27 
 
 
513 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  29.22 
 
 
505 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  30.97 
 
 
598 aa  49.3  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  23.35 
 
 
330 aa  49.3  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  27.42 
 
 
517 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  24.51 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.01 
 
 
596 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  25.52 
 
 
920 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  26.82 
 
 
495 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  27.6 
 
 
505 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  30 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  30.77 
 
 
544 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  22.22 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25 
 
 
519 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  27.71 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  27.03 
 
 
277 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  31 
 
 
286 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  29.88 
 
 
490 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  29.48 
 
 
521 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>