More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16240 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16240  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
416 aa  826    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.038458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2010  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  55.5 
 
 
415 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20970  cysteinyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 
425 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.842697  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2287  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  53.19 
 
 
414 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000304997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1836  cysteinyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 
419 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22240  cysteinyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
415 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0725298  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5930  Cysteine--tRNA ligase  52.87 
 
 
407 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13890  cysteinyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
438 aa  391  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0162649  normal  0.816908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1195  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  49.53 
 
 
423 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  0.0718449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2668  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  52.47 
 
 
422 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2442  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  52.87 
 
 
413 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1832  cysteinyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
412 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2140  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  52.14 
 
 
414 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2201  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  53.11 
 
 
412 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0760868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3049  cysteinyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
444 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0153969  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11810  cysteinyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 
422 aa  378  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.474792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1932  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  52.87 
 
 
403 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.11867  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2780  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  54.26 
 
 
405 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474656  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5399  cysteinyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
427 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139344  normal  0.289642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3153  cysteinyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
415 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0176981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3165  cysteinyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
415 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3215  cysteinyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 
415 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1544  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside ligase  50.24 
 
 
407 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.965113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1479  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  53.16 
 
 
404 aa  363  3e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.369055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2168  cysteinyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
426 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0428201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3478  cysteinyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2642  cysteinyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
464 aa  362  9e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.736924  normal  0.302095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2168  cysteinyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
404 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258931  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1172  cysteinyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
403 aa  352  7e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4502  cysteine/1-D-myo-inosityl 2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside ligase  50 
 
 
431 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2247  cysteinyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
420 aa  349  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12161  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
414 aa  346  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2628  cysteinyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
397 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1911  cysteinyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
410 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000250833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4892  cysteinyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
444 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00699487  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2322  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
412 aa  336  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165765  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1206  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
392 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1230  Cysteine--tRNA ligase  43.01 
 
 
372 aa  259  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4263  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
396 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3331  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
401 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.552746  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2860  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
400 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000103148  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4315  cysteinyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
401 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
481 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
493 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
486 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
460 aa  223  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
489 aa  222  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1691  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0549  Cysteine--tRNA ligase  41.53 
 
 
372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
479 aa  219  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
484 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
484 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
493 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
494 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
481 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
481 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
474 aa  217  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
474 aa  217  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
511 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
500 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 
476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0692  cysteinyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
499 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 
476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
481 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
472 aa  216  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
464 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 
476 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
500 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 
486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 
475 aa  212  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
485 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
478 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 
498 aa  210  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
466 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
501 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
480 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
466 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
483 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
494 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  35.7 
 
 
485 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
461 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
478 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 
485 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
458 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
461 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
456 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
495 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
489 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
459 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
456 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
456 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
469 aa  206  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
466 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
466 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
485 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
485 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
454 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>