31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12680  Protein of unknown function (DUF1469)  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  37.04 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  29.58 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  29.01 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  33.8 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  33.57 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  33.87 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  30.95 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  30.95 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  30.95 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  30.53 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  34.06 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  34.35 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  23.94 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  26.62 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  30.83 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  32.65 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  33.12 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  32.82 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  33.93 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  29.55 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  38.28 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  33.9 
 
 		 248 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  29.01 
 
 		 163 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  32.2 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  35.34 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  35.34 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  35.34 
 
 		 134 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>