More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4855 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 73 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  93.06 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  93.06 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  93.06 
 
 		 73 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  93.06 
 
 		 73 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  91.67 
 
 		 73 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  91.67 
 
 		 79 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  91.67 
 
 		 79 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  91.67 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  91.67 
 
 		 73 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  54.55 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  50 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  50 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  50.82 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  48.48 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  43.06 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  43.06 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  43.06 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  48.44 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  43.06 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  43.06 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  50.77 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  48.33 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  47.76 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  43.06 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 74 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  43.33 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  50 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  46.27 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>