32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3078 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1410  hypothetical protein  83.89 
 
 		 422 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4388  putative PAS/PAC sensor protein  93.95 
 
 		 430 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1496  MASE1 domain-containing protein  83.89 
 
 		 422 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0970  hypothetical protein  83.99 
 
 		 430 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1055  mase1  83.76 
 
 		 430 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0119  hypothetical protein  83.89 
 
 		 422 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0529  hypothetical protein  83.89 
 
 		 422 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.733006  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5790  putative integral membrane sensor protein  93.74 
 
 		 430 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5070  putative integral membrane sensor protein  93.74 
 
 		 430 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.520625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2292  hypothetical protein  83.99 
 
 		 430 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3078  putative integral membrane sensor protein  100 
 
 		 431 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0982  hypothetical protein  52.36 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0913  putative PAS/PAC sensor protein  52.12 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0844  putative PAS/PAC sensor protein  52.12 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0207923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0603  putative integral membrane sensor protein  49.75 
 
 		 429 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502306  normal  0.489405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 712 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 		 832 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  24.49 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  21.83 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49160  putative sensor protein  26.86 
 
 		 1120 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000588584 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 1211 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 1211 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 819 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0227  PAS /MASE1 sensor domain-containing protein  25 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 745 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.79 
 
 		 1070 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1695  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.37 
 
 		 594 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  28.67 
 
 		 1251 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 673 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.59 
 
 		 831 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25.36 
 
 		 2279 aa  43.1  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 553 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>