42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6112 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6112  NUDIX hydrolase  100 
 
 
288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.663998  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2793  NUDIX hydrolase  92.36 
 
 
288 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.335799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2782  NUDIX hydrolase  92.01 
 
 
288 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2168  NUDIX hydrolase  92.01 
 
 
288 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0533  NUDIX hydrolase  89.93 
 
 
285 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336062  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2700  NUDIX hydrolase  90.97 
 
 
285 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.170389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2842  NUDIX hydrolase  90.28 
 
 
285 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0495  thiamin pyrophosphokinase-related protein  79.37 
 
 
283 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0856896  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0775  NUDIX domain-containing protein  79.37 
 
 
285 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0606  nudix hydrolase  79.02 
 
 
285 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0590  nudix hydrolase  79.02 
 
 
285 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1523  thiamin pyrophosphokinase-related protein  78.67 
 
 
285 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3098  thiamin pyrophosphokinase-related protein  78.67 
 
 
285 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0067  thiamin pyrophosphokinase-related protein  78.67 
 
 
285 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2951  nudix hydrolase  78.67 
 
 
285 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.88626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0605  NUDIX hydrolase  68.18 
 
 
287 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0159393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4113  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  68.18 
 
 
282 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0335  NUDIX hydrolase  67.13 
 
 
282 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1874  hypothetical protein  48.29 
 
 
267 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0332068  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2075  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1753  NUDIX hydrolase  46.79 
 
 
284 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.871193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2237  NUDIX hydrolase  44.98 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.841467  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2212  NUDIX hydrolase  43.73 
 
 
280 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0979723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0214  MutT/nudix family protein  36.78 
 
 
292 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0853597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2749  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
285 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87640  predicted protein  33.33 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3504  NUDIX domain-containing protein  44.39 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1976  NUDIX hydrolase  40.64 
 
 
312 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.620391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0897  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.22115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0945  NUDIX hydrolase  33.2 
 
 
277 aa  119  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14808  predicted protein  36.7 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147852  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46967  thiamine pyrophosphokinase  36.08 
 
 
316 aa  109  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.934951  normal  0.22285 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02400  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
357 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3299  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
288 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0961007 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00193  thiamin pyrophosphokinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11110)  31.18 
 
 
319 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.415075 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07239  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2739  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.275113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5387  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3404  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707971  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3852  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2236  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3467  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>