39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5748 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 
165 aa  338  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  86.86 
 
 
137 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  86.13 
 
 
137 aa  240  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  86.13 
 
 
137 aa  240  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  38.93 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  32.61 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  33.09 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  33.83 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  20.95 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  47.92 
 
 
70 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1829  DNA binding domain-containing protein  47.62 
 
 
109 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  39.58 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  42.11 
 
 
315 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  42.59 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.59 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  42.59 
 
 
306 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  32.1 
 
 
315 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  40.35 
 
 
315 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.59 
 
 
306 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  40.91 
 
 
67 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  47.73 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  40.74 
 
 
306 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  26.26 
 
 
248 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  38.89 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  36.51 
 
 
305 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  44.44 
 
 
306 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  39.29 
 
 
306 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  40.54 
 
 
73 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0893  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  43.14 
 
 
230 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  47.73 
 
 
94 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2899  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 
127 aa  41.6  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  30 
 
 
206 aa  41.6  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  44.64 
 
 
293 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  47.73 
 
 
95 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  47.37 
 
 
78 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0059  DNA binding domain-containing protein  39.66 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 
308 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  38.3 
 
 
80 aa  40.8  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>