More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5681 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5681  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3745  two component transcriptional regulator  98.24 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4623  two component transcriptional regulator  98.24 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.337483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6013  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2064  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410384  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1970  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0400579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2100  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2083  winged helix family two component response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.55 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.09 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.55 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.55 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.55 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.72 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.16 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  30.4 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.88 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1450  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  32.14 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  32.14 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  29.26 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  29.26 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  30.63 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45880  putative two-component response regulator  31.08 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.08 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 249 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1580  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.128837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1655  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  hitchhiker  0.000274191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1946  transcriptional regulatory protein PhoP  30.22 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.53 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  30.63 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  28.38 
 
 		 226 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  28.89 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1498  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  32.74 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1542  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  27.95 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.87 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1191  transcriptional regulatory protein YedW  31.08 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  27.95 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1724  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  27.95 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  27.95 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  27.95 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00532  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CusS  27.95 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.15 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.4 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1171  transcriptional regulatory protein YedW  31.08 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  27.95 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  27.95 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  30.09 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  30.53 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2714  putative two-component response regulator  30.18 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31960  putative two-component response regulator  30.18 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.029957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  31.08 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  31.08 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  33.77 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01884  predicted DNA-binding response regulator in two-component system with YedV  26.82 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000533293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2748  transcriptional regulatory protein YedW  26.82 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892088  normal  0.227347 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01874  hypothetical protein  26.82 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000061937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1746  two component transcriptional regulator  28.89 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000480188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  29.78 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2200  transcriptional regulatory protein YedW  26.82 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000454941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1216  transcriptional regulatory protein YedW  26.82 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000203871  normal  0.637592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0914  transcriptional regulatory protein YedW  26.82 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>